المجهر البيولوجي هو جهاز بصري دقيق يُستخدم لرصد المقاطع البيولوجية، والخلايا البيولوجية، والبكتيريا، ومزارع الأنسجة الحية، وترسيب السوائل، وغيرها من الأجسام الشفافة أو شبه الشفافة، والمساحيق، والجسيمات الدقيقة، وغيرها. تُستخدم المجاهر البيولوجية في المستشفيات والجامعات ومعاهد البحث لمراقبة الكائنات الدقيقة، والخلايا، والبكتيريا، ومزارع الأنسجة، والمعلقات، والرواسب، وغيرها. ويمكنها رصد عملية تكاثر الخلايا والبكتيريا وانقسامها باستمرار في أوساط الزراعة. ويُستخدم على نطاق واسع في مجالات علم الخلايا، وعلم الطفيليات، وعلم الأورام، وعلم المناعة، والهندسة الوراثية، وعلم الأحياء الدقيقة الصناعية، وعلم النبات، وغيرها. تشمل المعايير التقنية البصرية: الفتحة الرقمية، والدقة، والتكبير، وعمق البؤرة، وعرض المجال، وفرق التغطية، ومسافة العمل، وغيرها.